Ein Wertpapierabwicklungssystem ist ein System, mit welchem die Börse den Börsenhandel einschließlich aller anfallenden Börsengeschäfte durchführt. Jede Börse unterhält ihr eigenes Wertpapierabwicklungssystem, die Anbindung externer Systeme an die Systeme der Börsen ist jedoch grundsätzlich möglich. Das Börsengesetz regelt, unter welchen Voraussetzungen externe Systeme an das Wertpapierabwicklungssystem einer Börse angeschlossen werden dürfen. Neben eigenen Kontrolleinrichtungen der jeweiligen Börse übt auch die BaFin eine Kontrolle über bestehende Wertpapierabwicklungssysteme aus. Alle zugelassenen Wertpapierabwicklungssysteme müssen nicht nur zuverlässig, sondern auch ausreichend schnell und wirtschaftlich effizient arbeiten. Zudem müssen externe Systeme neben den rechtlichen Gegebenheiten auch die technischen Ansprüche der jeweiligen Börse erfüllen.